Η ιστορία ξεκινά με τον Ben να λαμβάνει μια ένδειξη με τη μορφή ενός vintage Locket με ένα κρυπτικό μήνυμα. Αυτό τον οδηγεί σε μια περιπέτεια που οδηγεί σε σφαίρα σε όλη την Ευρώπη, όπου πρέπει να αποκρυπτογραφήσει τα ιστορικά αντικείμενα και να βρει το κλειδί για το κρυμμένο θόλο των Freemasons.
Κατά μήκος του δρόμου, ενώθηκε με τον συνεργάτη του Riley Poole και τον πατέρα του Patrick Gates, ο οποίος απρόθυμα εμπλέκεται στην αναζήτηση. Αντιμετωπίζουν συνεχή αντίθεση από τον Ian Howe, έναν αντίπαλο κυνηγό θησαυρού που επιδιώκει το ίδιο βραβείο και μια πονηρή και μυστηριώδη γυναίκα που ονομάζεται Abigail, η οποία ισχυρίζεται ότι έχει τους δικούς της λόγους για την αναζήτηση του θησαυρού.
Το ταξίδι τους μεταφέρει σε μέρη όπως το Λονδίνο, το Παρίσι και το Σινικό Τείχος της Κίνας, καθώς ξεδιπλώνονται ενδείξεις κρυμμένες μέσα σε ιστορικά έγγραφα και ορόσημα. Η ταινία διαθέτει μια συναρπαστική κορύφωση, όπου ο Ben πρέπει να αγωνιστεί ενάντια στο χρόνο για να βρει τον θησαυρό και να καθαρίσει το όνομα του πατέρα του.
Τελικά, το "National Treasure:Book of Secrets" είναι μια διασκεδαστική, γεμάτη δράση περιπέτεια που συνδυάζει την ιστορική ίντριγκα με το χιούμορ και την καρδιά. Συνεχίζει την κληρονομιά της πρώτης ταινίας, προσφέροντας ένα μαγευτικό μυστήριο που κρατάει τους θεατές να ασχοληθούν μέχρι το τέλος.