* Οι κίνδυνοι της ύβρεως: Η προσπάθεια των αδελφών Έλρικ να χρησιμοποιήσουν την αλχημεία για να αναβιώσουν τη μητέρα τους οδηγεί στον ακρωτηριασμό τους, τονίζοντας τους πιθανούς κινδύνους της ανεξέλεγκτης φιλοδοξίας και την επιδίωξη της γνώσης χωρίς να κατανοούν τις πλήρεις επιπτώσεις της.
* Η αναζήτηση της αλήθειας: Η σειρά διερευνά τη φύση της αλήθειας και πώς μπορεί να παραποιηθεί ή να χειραγωγηθεί, ειδικά στο πλαίσιο του στρατιωτικού προγράμματος και του προγράμματος State Alchemist.
* Η σημασία της ανθρώπινης σύνδεσης και ενσυναίσθησης: Η σειρά δίνει έμφαση στην αξία των ανθρώπινων σχέσεων και στον τρόπο με τον οποίο μπορούν να βοηθήσουν τα άτομα να περιηγηθούν στην πολυπλοκότητα των δικών τους εμπειριών. Αυτό είναι εμφανές στους ισχυρούς δεσμούς μεταξύ των αδερφών Έλρικ, καθώς και στις διάφορες σχέσεις που δημιουργούν σε όλη τη διάρκεια του ταξιδιού τους.
* Οι ηθικές επιπτώσεις της επιστημονικής προόδου: Ο Fullmetal Alchemist παλεύει με τα ηθικά διλήμματα που τίθενται από ισχυρές τεχνολογίες, όπως η αλχημεία, και την πιθανότητα κατάχρησης. Ενθαρρύνει το κοινό να αναλογιστεί την ευθύνη που συνεπάγεται η γνώση και οι εφαρμογές της.
Τελικά, η σειρά προτείνει ότι, ενώ η επιδίωξη της γνώσης είναι πολύτιμη, πρέπει να εξισορροπείται με σοφία, ενσυναίσθηση και βαθιά κατανόηση της πιθανής επίδρασής της στον κόσμο και στους γύρω μας.