Στο μυθιστόρημα, το Φάντασμα είναι ένας παραμορφωμένος άντρας που φοράει μια μάσκα για να κρύψει το πρόσωπό του. Ζει στις κατακόμβες κάτω από την όπερα και χρησιμοποιεί τη μουσική του ιδιοφυΐα για να ελέγχει τους τραγουδιστές της όπερας και τους σκηνοθέτες. Το Phantom ερωτεύεται μια νεαρή σοπράνο που ονομάζεται Christine Daaé και γίνεται εμμονή μαζί της. Την απαγάγει και την πηγαίνει στη φωλιά του στις κατακόμβες. Η Christine τελικά δραπετεύει από το Phantom, το οποίο εξαφανίζεται μέσα στη νύχτα.
Η μοίρα του Φαντάσματος μένει αμφίσημη στο μυθιστόρημα. Στην αρχική γαλλική έκδοση του μυθιστορήματος, ο Φάντασμα λέγεται ότι κρεμάστηκε στις κατακόμβες. Ωστόσο, στην αγγλική μετάφραση, το Phantom λέγεται ότι εξαφανίστηκε στους υπονόμους του Παρισιού.