* Ο Χάρι Πότερ, ο νεαρός μάγος, που αντιπροσωπεύει το καλό: Έχει την αποστολή να σταματήσει τον Λόρδο Βόλντεμορτ από το να αποκτήσει την Πέτρα του Μάγου, ένα ισχυρό μαγικό τεχνούργημα που θα έδινε αθανασία και απέραντη δύναμη.
* Λόρδος Βόλντεμορτ, ο Σκοτεινός Άρχοντας, που αντιπροσωπεύει το κακό: Έχει εμμονή να ανακτήσει το χαμένο σώμα και τη δύναμή του και βλέπει την Πέτρα του Μάγου ως το κλειδί για να το πετύχει.
Αυτή η κεντρική σύγκρουση περιπλέκεται περαιτέρω από:
* Η απειλή για το Χόγκουαρτς και τον κόσμο των μάγων: Η καταδίωξη της Πέτρας από τον Βόλντεμορτ θέτει σε κίνδυνο ολόκληρη τη μαγική κοινότητα, καθώς είναι μια αδίστακτη και καταστροφική δύναμη.
* Ο προσωπικός αγώνας του Χάρι: Πρέπει να συμβιβαστεί με τις δικές του μαγικές ικανότητες και να αντιμετωπίσει την αλήθεια για τον θάνατο των γονιών του και τη σύνδεσή του με τον Βόλντεμορτ.
* Οι εσωτερικοί αγώνες άλλων χαρακτήρων: Χαρακτήρες όπως ο Σνέιπ, ο Ντάμπλντορ, ακόμα και ο Ρον και η Ερμιόνη αντιμετωπίζουν τις δικές τους εσωτερικές συγκρούσεις και κίνητρα, προσθέτοντας πολυπλοκότητα στην ιστορία.
Η σύγκρουση στο Harry Potter and the Sorcerer's Stone επιλύεται όταν ο Χάρι, με τη βοήθεια των φίλων του, νικά τον Βόλντεμορτ και τον εμποδίζει να αποκτήσει την Πέτρα. Αυτή η νίκη καθιερώνει τον Χάρι ως ήρωα και θέτει τις βάσεις για τις μελλοντικές του μάχες ενάντια στις δυνάμεις του σκότους.