Στο βιβλίο, ο Clarke υποστηρίζει ότι η κυβέρνηση Μπους αγνόησε τις προειδοποιήσεις από τις υπηρεσίες πληροφοριών σχετικά με την απειλή της τρομοκρατίας και ότι αυτή η αμέλεια συνέβαλε στις επιθέσεις της 11ης Σεπτεμβρίου. Επικρίνει επίσης την απάντηση της κυβέρνησης στις επιθέσεις και υποστηρίζει ότι οι πόλεμοι στο Αφγανιστάν και το Ιράκ έχουν κάνει τις Ηνωμένες Πολιτείες λιγότερο ασφαλείς.
Το Shady Aftermath έχει επαινεθεί από ορισμένους για την εμπιστευτική του οπτική σχετικά με τις επιθέσεις της 11ης Σεπτεμβρίου και για την κριτική του στον χειρισμό της τρομοκρατίας από την κυβέρνηση Μπους. Ωστόσο, έχει επίσης επικριθεί από ορισμένους για την αρνητική απεικόνιση της κυβέρνησης Μπους και για την έλλειψη συγκεκριμένων στοιχείων που να υποστηρίζουν ορισμένους από τους ισχυρισμούς της.