Μέθοδοι έρευνας χρησιμοποιούν τόσο εθνογραφία όσο και μουσική μεταγραφή και ανάλυση και περιλαμβάνουν επιτόπια εργασία και συνεντεύξεις με πληροφοριοδότες. Μερικοί εθνομουσικολόγοι ερμηνεύουν επίσης τη μουσική που μελετούν, ενώ άλλοι εστιάζουν περισσότερο στην ανάλυση και την ερμηνεία.
Εργασία πεδίου επιτρέπει στους εθνομουσικολόγους να βυθιστούν στη μουσική και τον πολιτισμό των ανθρώπων που μελετούν, επιτρέποντάς τους να κατανοήσουν βαθιά τον ρόλο που παίζει η μουσική στη ζωή τους.
Επειδή οι πολιτισμοί και οι μουσικές πρακτικές αλλάζουν συνεχώς, οι εθνομουσικολόγοι συχνά συλλέγουν ηχογραφήσεις και βίντεο, μεταγράφουν και αναλύουν μουσικές παραστάσεις, δημιουργούν μουσικά όργανα, συνθέτουν και διασκευάζουν μουσική και τεκμηριώνουν τα αποτελέσματα της έρευνάς τους σε βιβλία, άρθρα και άλλες δημοσιεύσεις.