Ο Séguy γεννήθηκε στην Τουλόν της Γαλλίας την 1η Ιουλίου 1877. Έδειξε πάθος για τη φυσική ιστορία σε νεαρή ηλικία και άρχισε να συλλέγει έντομα σε ηλικία 12 ετών. Σπούδασε ιατρική στο Πανεπιστήμιο του Μονπελιέ και αποφοίτησε το 1902.
Ο Séguy ξεκίνησε την καριέρα του ως στρατιωτικός γιατρός, αλλά σύντομα αφοσιώθηκε στην εντομολογία. Εργάστηκε στο National d'histoire naturelle στο Παρίσι από το 1906 μέχρι τη συνταξιοδότησή του το 1942. Κατά τη διάρκεια της παραμονής του στο μουσείο, επιμελήθηκε τη συλλογή των Δίπτερων και δημοσίευσε πολλά επιστημονικά άρθρα και βιβλία για το θέμα.
Ο κύριος τομέας έρευνας του Séguy ήταν η οικογένεια Muscidae και έγινε παγκόσμιος ειδικός σε αυτήν την ομάδα. Περιέγραψε πάνω από 1.000 νέα είδη Muscidae και δημοσίευσε αρκετές μονογραφίες και καταλόγους για την οικογένεια. Εργάστηκε επίσης σε άλλες οικογένειες των Δίπτερων, συμπεριλαμβανομένων των Tephritidae, Conopidae και Cecidomyiidae.
Εκτός από το επιστημονικό του έργο, ο Séguy ήταν επίσης ενεργό μέλος πολλών επιστημονικών εταιρειών, συμπεριλαμβανομένης της Société entomologique de France και της Royal Entomological Society of London. Του απονεμήθηκε το Linnean Medal of the Linnean Society of London το 1939 και το Prix Constant από την Ακαδημία Επιστημών του Παρισιού το 1949.
Ο Séguy πέθανε στο Παρίσι στις 23 Οκτωβρίου 1951, σε ηλικία 74 ετών. Ήταν ένας πολυγραφότατος εντομολόγος που συνέβαλε σημαντικά στη μελέτη των Δίπτερων, και το έργο του εξακολουθεί να αναφέρεται ευρέως από τους επιστήμονες σήμερα.