Ωστόσο, είναι σημαντικό να κατανοήσουμε ότι ακόμη και οι πιο λαμπροί καλλιτέχνες έχουν τους περιορισμούς και τις προκλήσεις τους. Ορισμένες πτυχές που θα μπορούσαν να θεωρηθούν «αποτυχίες» ή αδυναμίες στο έργο του Ραφαήλ, αν και συχνά συζητούνται μεταξύ των ιστορικών τέχνης, περιλαμβάνουν:
* Περιορισμένη εστίαση στο συναίσθημα και τον ρεαλισμό: Σε σύγκριση με τον Μιχαήλ Άγγελο, οι φιγούρες του Ραφαήλ συχνά στερούνται το συναισθηματικό βάθος και την ψυχολογική πολυπλοκότητα που χαρακτηρίζουν το έργο του Φλωρεντίνου δασκάλου. Ορισμένοι κριτικοί προτείνουν ότι ο Ραφαήλ έδινε προτεραιότητα στην εξιδανικευμένη ομορφιά και την αρμονία έναντι του συναισθηματικού ρεαλισμού.
* Εξάρτηση από βοηθούς: Το στούντιο του Ραφαήλ ήταν γνωστό για τη μεγάλη ομάδα βοηθών του και ορισμένοι κριτικοί υποστηρίζουν ότι αυτό οδήγησε σε ασυνέπειες στη δουλειά του, ιδιαίτερα τα επόμενα χρόνια. Ενώ η επίβλεψη και η καθοδήγηση του Raphael ήταν εμφανείς, συζητείται αν το συνολικό καλλιτεχνικό όραμα ήταν πάντα δικό του.
* Η διαμάχη για τη "Μεταμόρφωση": Ο τελευταίος πίνακας του Ραφαήλ, «Η Μεταμόρφωση», ολοκληρώθηκε μετά θάνατον από το ατελιέ του. Ενώ η σύνθεση και η ιδέα αποδίδονται στον Ραφαήλ, η εκτέλεση πιστεύεται ότι αφορούσε πολλά χέρια. Αυτό οδήγησε σε συζητήσεις σχετικά με τον βαθμό στον οποίο το τελικό έργο αντικατοπτρίζει τις αληθινές προθέσεις του Ραφαέλ.
Είναι σημαντικό να θυμάστε ότι αυτές οι πτυχές δεν είναι αποτυχίες με την έννοια της καλλιτεχνικής ανικανότητας. Μάλλον, είναι περιορισμοί ή τομείς όπου η καλλιτεχνική προσέγγιση του Ραφαήλ διέφερε από εκείνη των συγχρόνων του ή όπου οι προκλήσεις της εποχής του επηρέασαν το έργο του.
Είναι πιο γόνιμο να εκτιμάς τους θριάμβους του Ραφαήλ, την απίστευτη ικανότητά του να αιχμαλωτίζει την ομορφιά, τη χάρη και την αρμονία στο έργο του και τη διαρκή του επίδραση στην ιστορία της τέχνης. Η κληρονομιά του είναι μια εξαιρετική ικανότητα, καλλιτεχνική λαμπρότητα και διαρκής επιρροή.