Τι είναι ο δείκτης Jacobsen;

Ο δείκτης Jacobsen ενός φυλογενετικού δέντρου είναι ένα μέτρο της διακλάδωσής του ή ο βαθμός στον οποίο το δέντρο περιέχει μικρά εσωτερικά κλαδιά. Ορίζεται ως ο λόγος του συνολικού μήκους του δέντρου (το άθροισμα των μηκών όλων των κλαδιών στο δέντρο) προς το ελάχιστο δυνατό μήκος δέντρου, που είναι το μήκος ενός δέντρου με τον ίδιο αριθμό ταξινομικών κατηγοριών και χωρίς εσωτερικά κλαδιά ( όλα τα taxa συνδέονται απευθείας με τη ρίζα).

Ένας υψηλός δείκτης Jacobsen υποδεικνύει ένα δέντρο με πολλά μικρά εσωτερικά κλαδιά, τα οποία μπορεί να είναι το αποτέλεσμα μιας ταχείας ακτινοβολίας ταξινομικών κατηγοριών ή ενός υψηλού ρυθμού εξέλιξης χαρακτήρα. Ένας χαμηλός δείκτης Jacobsen υποδεικνύει ένα δέντρο με λίγα μικρά εσωτερικά κλαδιά, τα οποία μπορεί να είναι το αποτέλεσμα μιας αργής ακτινοβολίας ταξινομικών κατηγοριών ή ενός χαμηλού ρυθμού εξέλιξης χαρακτήρων.

Ο δείκτης Jacobsen χρησιμοποιείται συχνά για τη σύγκριση της σχετικής διακλαδικότητας διαφορετικών φυλογενετικών δέντρων και μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την αξιολόγηση της προσαρμογής διαφορετικών εξελικτικών μοντέλων σε ένα δεδομένο σύνολο δεδομένων.