Το Breeding είναι ένα χαρακτηριστικό που εισήχθη στις επόμενες γενιές των παιχνιδιών Pokemon και δεν είναι διαθέσιμο στη σειρά Mystery Dungeon. Στο Explorers of Sky, αποκτάτε Pokemon στρατολογώντας τα στην ομάδα σας αφού διασωθούν από ένα μπουντρούμι.