Ενώ το Master Ball είναι βασικό στοιχείο στα περισσότερα παιχνίδια Pokemon, απουσιάζει από το Pokemon Colosseum και το sequel του, Pokemon XD:Gale of Darkness. Αυτή η απόφαση πιθανότατα λήφθηκε για να τονίσει την εστίαση του παιχνιδιού στη σύλληψη Pokemon χρησιμοποιώντας το σύστημα "Snap", το οποίο συνεπάγεται την αποδυνάμωση της αποφασιστικότητας των Pokemon και όχι απλώς τον αποκλεισμό τους.
Η έλλειψη Master Ball στο Colosseum και το XD προσθέτει στη μοναδική πρόκληση του παιχνιδιού και ενθαρρύνει τους παίκτες να κατακτήσουν την τέχνη της σύλληψης Pokemon χωρίς τη βοήθεια αυτού του υπερβολικού αντικειμένου.