Μερικές από τις βασικές διαφορές μεταξύ του manga και του anime περιλαμβάνουν:
* Η σειρά των συμβάντων είναι διαφορετική. Στο manga, ορισμένα γεγονότα συμβαίνουν νωρίτερα ή αργότερα από ότι στο anime. Για παράδειγμα, στο manga, ο Teito Klein συναντά τη Frau στο πρώτο κεφάλαιο, ενώ στο anime, δεν συναντιούνται μέχρι το επεισόδιο 8.
* Ορισμένοι χαρακτήρες είναι διαφορετικοί. Στο manga, υπάρχουν κάποιοι χαρακτήρες που δεν εμφανίζονται στο anime και κάποιοι χαρακτήρες που εμφανίζονται στο anime δεν εμφανίζονται στο manga. Για παράδειγμα, ο χαρακτήρας της Ceres δεν εμφανίζεται στο manga, ενώ ο χαρακτήρας του Mikage δεν εμφανίζεται στο anime.
* Το τέλος είναι διαφορετικό. Το manga και το anime έχουν διαφορετικό τέλος. Στο manga, το ταξίδι του Teito Klein και της Frau καταλήγει διαφορετικά από ό,τι στο anime.
Συνολικά, το 07-Ghost manga και το anime είναι δύο ξεχωριστές και ξεχωριστές ερμηνείες της ίδιας ιστορίας. Ενώ μοιράζονται κάποιες ομοιότητες, υπάρχουν επίσης πολλές διαφορές μεταξύ των δύο εκδόσεων.