Σε αυτή τη σειρά, ο κεντρικός χαρακτήρας, Mikey Kudo, και οι φίλοι του μεταφέρονται στον ψηφιακό κόσμο και δένονται με τους συνεργάτες της Digimon. Ωστόσο, αντί να μεταμορφωθούν άμεσα, «συγχωνεύονται» με το Digimon τους, με αποτέλεσμα μια υβριδική μορφή ανθρώπου-Digimon που ονομάζεται «Fusion Fighters». Αυτό τους επιτρέπει να χρησιμοποιούν τις ικανότητες των Digimon και να πολεμούν μαζί τους.
Η σειρά διερευνά τα θέματα της φιλίας, της ομαδικής εργασίας και της υπέρβασης των προκλήσεων, ενώ περιηγείται στους κινδύνους του Ψηφιακού Κόσμου.