- The Last Temptation of Christ (1988):Αυτή η ταινία προκάλεσε διαμάχη λόγω της απεικόνισης του Ιησού ως ενός ελαττωματικού και αντικρουόμενου χαρακτήρα. Αντιμετώπισε έντονη κριτική από θρησκευτικές ομάδες και πυροδότησε διαμαρτυρίες, περιορίζοντας τις επιδόσεις του στο box office και τη συνολική επιτυχία του.
- Νέα Υόρκη, Νέα Υόρκη (1977):Αυτό το μουσικό δράμα έλαβε μικτές αντιδράσεις από κριτικούς και κοινό. Κάποιοι βρήκαν το ύφος και τον τόνο της ταινίας ασυνεπείς, ενώ άλλοι εκτίμησαν την καλλιτεχνική της φιλοδοξία. Δεν πέτυχε το ίδιο επίπεδο κριτικής και εμπορικής επιτυχίας με πολλά άλλα έργα του Σκορσέζε.
- Gangs of New York (2002):Παρά τα εντυπωσιακά οπτικά και τις ερμηνείες του, το Gangs of New York επικρίθηκε για τη μεγάλη διάρκεια, την περίπλοκη αφήγηση και την ανάμεικτη ανάπτυξη χαρακτήρων. Αν και ήταν μια μέτρια επιτυχία στο box office, δεν είχε την εμπορική απήχηση και την αποδοχή των κριτικών ορισμένων από τις άλλες ταινίες του Σκορσέζε με θέμα το έγκλημα.
- The Aviator (2004):Το Aviator έλαβε κριτικούς επαίνους για την ερμηνεία του Χάουαρντ Χιουζ από τον Λεονάρντο Ντι Κάπριο, αλλά αντιμετώπισε κριτική για τον εκτεταμένο χρόνο λειτουργίας του και την πυκνή αφήγηση. Ενώ η ταινία ήταν μια οικονομική επιτυχία, δεν άφησε τον ίδιο πολιτιστικό αντίκτυπο με μερικά από τα πιο εμβληματικά έργα του Σκορσέζε.
Αυτές οι ταινίες μπορεί να μην θεωρούνται οι «χειρότερες» με την έννοια ότι είναι κακοσχεδιασμένες ή στερούνται αξίας. Αντίθετα, δεν πέτυχαν την ευρεία αναγνώριση ή απήχηση στο κοινό όπως μερικά από τα άλλα αριστουργήματα του Σκορσέζε, με αποτέλεσμα ανάμεικτες ή λιγότερο ενθουσιώδεις απαντήσεις.