Η πλοκή του Monsters University έχει ως εξής:
Ο James P. "Sully" Sullivan και ο καλύτερος φίλος του, Michael "Mike" Wazowski, γίνονται δεκτοί στο Monsters University. Και οι δύο θέλουν να ενταχθούν στο Roar Omega Roar (ROR), την κορυφαία τρομακτική αδελφότητα, αλλά απορρίπτονται επειδή δεν είναι αρκετά τρομακτικοί. Συμμετέχουν στην Oozma Kappa (ΟΚ), μια αδελφότητα που αποτελείται από ακατάλληλους και παρίες. Η Sully και ο Mike γίνονται στενοί φίλοι και μαθαίνουν να συνεργάζονται. Μαθαίνουν επίσης ότι ο φόβος δεν είναι το πιο σημαντικό πράγμα στη ζωή. η φιλία και η ομαδική εργασία είναι πιο σημαντικές.