* The Légion d' Honneur (Legion of Honour) , το υψηλότερο γαλλικό παράσημο αξίας, του απονεμήθηκε το 1878 και το 1881.
* The Copley Medal (1874) , ένα από τα παλαιότερα και πιο έγκριτα επιστημονικά βραβεία από τη Βασιλική Εταιρεία του Λονδίνου.
* Το μετάλλιο Albert (1882) , βραβευμένο από τη Βασιλική Εταιρεία Τεχνών ως αναγνώριση της εξαιρετικής συνεισφοράς του στην επιστήμη και την τεχνολογία.
* Εκλέχτηκε επίσης σε πολλές αναγνωρισμένες ακαδημίες , συμπεριλαμβανομένης της Γαλλικής Ακαδημίας Επιστημών, της Βασιλικής Εταιρείας του Λονδίνου και της Γαλλικής Ακαδημίας.
Αυτά είναι μερικά μόνο από τα πολλά βραβεία και διακρίσεις που έλαβε ο Λουί Παστέρ σε όλη τη διάρκεια της καριέρας του. Θεωρείται ευρέως ένας από τους σημαντικότερους επιστήμονες όλων των εποχών και το έργο του είχε βαθύ αντίκτυπο στην ανθρώπινη υγεία και ευημερία.