1. Βραβείο Νόμπελ Ειρήνης:Το 2001, ο ΠΟΥ απονεμήθηκε από κοινού το Νόμπελ Ειρήνης μαζί με τα Ηνωμένα Έθνη για το έργο τους στην «οργάνωση και διεύθυνση της παγκόσμιας προσπάθειας υγείας για την καταπολέμηση του HIV/AIDS, της ελονοσίας και άλλων ασθενειών».
2. Βραβείο Prince Mahidol:Το βραβείο Prince Mahidol είναι ένα από τα πιο αναγνωρισμένα παγκόσμια βραβεία υγείας, που απονέμεται από το Ίδρυμα Prince Mahidol Award στην Ταϊλάνδη. Ο ΠΟΥ έχει λάβει το βραβείο Prince Mahidol σε πολλές περιπτώσεις, μεταξύ των οποίων το 1995, το 2001 και το 2010.
3. Sasakawa Health Prize:Το Sasakawa Health Prize, που απονέμεται από το The Sasakawa Health Foundation, αναγνωρίζει άτομα και οργανισμούς που έχουν συμβάλει σημαντικά στην παγκόσμια υγεία. Ο ΠΟΥ έχει τιμηθεί με το Βραβείο Υγείας Sasakawa πολλές φορές, μεταξύ των οποίων το 1999, το 2007 και το 2012.
4. Μνημιακό Βραβείο για τη Δημόσια Υγεία του Dr. Lee Jong-wook:Αυτό το βραβείο, που καθιερώθηκε από την κυβέρνηση της Δημοκρατίας της Κορέας, απονέμεται σε άτομα ή οργανισμούς που έχουν κάνει εξαιρετική συνεισφορά στη δημόσια υγεία. Ο ΠΟΥ έχει απονεμηθεί το Βραβείο Μνήμης του Δρ. Lee Jong-wook σε πολλές περιπτώσεις, μεταξύ των οποίων το 2007, το 2012 και το 2017.
5. Βραβείο Gates για την Παγκόσμια Υγεία:Το Ίδρυμα Bill &Melinda Gates καθιέρωσε το Βραβείο Gates για την Παγκόσμια Υγεία για να αναγνωρίσει και να υποστηρίξει εξαιρετικούς ηγέτες στον τομέα της παγκόσμιας υγείας. Ο ΠΟΥ έχει λάβει το βραβείο Gates σε πολλές περιπτώσεις, μεταξύ των οποίων το 2007 και το 2012.
Αξίζει να σημειωθεί ότι ο Παγκόσμιος Οργανισμός Υγείας συνεχίζει να λαμβάνει διάφορα βραβεία, αναγνωρίσεις και διακρίσεις από κυβερνήσεις, οργανισμούς και ιδρύματα παγκοσμίως ως αναγνώριση των συνεχιζόμενων προσπαθειών του για τη βελτίωση της παγκόσμιας υγείας και ευημερίας.