- The Garvan-Olin Medal from the American Chemical Society (1983):Αυτό το διάσημο βραβείο αναγνωρίζει εξαιρετικά επιτεύγματα στον τομέα της χημείας.
- The Tolman Medal from the Southern California Section of the American Chemical Society (1985):Αυτό το βραβείο απονέμεται σε άτομο που έχει κάνει σημαντικές συνεισφορές στον τομέα της χημείας.
- Βραβείο Υποτρόφων της Αμερικανικής Ένωσης για την Προώθηση της Επιστήμης (AAAS) (1987):Αυτό το βραβείο απονέμεται σε άτομα που έχουν κάνει εξαιρετική συμβολή στην πρόοδο της επιστήμης.
- Βραβείο The National Organization for Women (NOW) Woman of the Year Award (1990):Αυτό το βραβείο αναγνωρίζει τη σημαντική συνεισφορά των γυναικών σε διάφορους τομείς.
- The L'Oréal-UNESCO For Women in Science Awards (2005):Η Marie Daly ήταν μία από τις πέντε αποδέκτες αυτού του βραβείου, το οποίο αναγνωρίζει εξαιρετικά επιτεύγματα γυναικών στην επιστημονική έρευνα.
- The National Medal of Science (2005):Πρόκειται για μια από τις υψηλότερες τιμές που απονέμονται σε επιστήμονες στις Ηνωμένες Πολιτείες, αναγνωρίζοντας την εξαιρετική συνεισφορά τους στον τομέα.
Τα επιτεύγματα και η επίδραση της Marie M. Daly στον τομέα της χημείας έχουν αναγνωριστεί και γιορταστεί ευρέως, και τα βραβεία της χρησιμεύουν ως απόδειξη για τα εξαιρετικά επιτεύγματα και τη συνεισφορά της.