Τηλεόραση:
* The Rookie (2018 - σήμερα): Λοχίας «Νάιλα» Χάρπερ
* The Wire (2002-2008): Ο ντετέκτιβ "Beadie" Russell
* Six Feet Under (2001-2005): Μπρέντα Τσένογουιτ
* ER (1994-2009): Δρ Τζάνετ Κόμπερν
* The X-Files (1993-2018): Δρ Αν Μπακλ
* The West Wing (1999-2006): Δρ Γκρέις Μπάρνετ
* The Good Wife (2009-2016): Η δικαστής Christine "Chrissy" Sexton
* Κάστρο (2009-2016): Ο ντετέκτιβ Ryan "Ritter" Russell
* Law &Order:Special Victims Unit (1999-σήμερα): Διάφοροι ρόλοι
* Grey's Anatomy (2005-σήμερα): Δρ Μπεθ Χάντερ
* NCIS (2003-σήμερα): Δρ. Wendy Kieffer
* Criminal Minds (2005-2020): Δρ Έρικα Ράινχαρτ
* Μοντέρνα Οικογένεια (2009-2020): Νοσοκόμα Παμ
Ταινία:
* The Sisterhood of the Traveling Pants (2005): Κυρία Χρυσό
* The Perfect Score (2004): Κυρία Μπέικερ
* The Day After Tomorrow (2004): Δρ Λούσι Χολ
* The Prince of Tides (1991): Μάρθα Μακ Μάχον
* Thelma &Louise (1991): Carhop
* The Silence of the Lambs (1991): Γυναίκα στο βενζινάδικο
* The Player (1992): γραμματέας
Αυτή είναι μόνο μια μερική λίστα, καθώς η Amy Aquino συμμετείχε σε πολλά άλλα έργα σε όλη τη διάρκεια της καριέρας της. Είναι μια πολύπλευρη ηθοποιός με έντονη παρουσία τόσο στη μεγάλη όσο και στη μικρή οθόνη.