Ταινίες:
* Pink Flamingos (1972): Ο Γουότερς έπαιξε τον ρόλο του «The Divine» σε αυτή την καλτ κλασική ταινία.
* Desperate Living (1977): Εμφανίστηκε επίσης ως "The Divine" σε αυτή την ταινία.
* Polyester (1981): Ο Γουότερς έπαιξε τον ρόλο του «The Divine» και σκηνοθέτησε επίσης αυτή την ταινία.
* Hairspray (1988): Ο Γουότερς είχε ρόλο ως υπάλληλος δισκοπωλείου σε αυτή την ταινία.
* Cry-Baby (1990): Έκανε μια σύντομη εμφάνιση ως διευθυντής σχολείου.
* Serial Mom (1994): Ο Γουότερς έπαιξε το ρόλο του "The Divine" σε αυτή την ταινία.
* Pecker (1998): Εμφανίστηκε ξανά ως «The Divine» σε αυτή την ταινία.
* A Dirty Shame (2004): Ο Γουότερς έπαιξε το ρόλο του "The Divine" σε αυτή την ταινία.
* This Filthy World (2006): Εμφανίστηκε σε αυτό το ντοκιμαντέρ για τη ζωή και το έργο του.
* Fruitvale Station (2013): Ο Γουότερς εμφανίστηκε ως δημοσιογράφος.
* The House That Jack Built (2018): Ο Γουότερς έπαιξε έναν μικρό ρόλο σε αυτή την ταινία του Λαρς φον Τρίερ.
Τηλεόραση:
* The Simpsons (1991): Ο Γουότερς εξέφρασε τη φωνή του στο επεισόδιο "Homer Defined".
* South Park (1997): Εκφράστηκε επίσης στο επεισόδιο "Chef Aid".
* The Sopranos (2001): Ο Γουότερς έπαιξε ως σκηνοθέτης στο επεισόδιο «The Blue Comet».
* Arrested Development (2003): Είχε έναν μικρό ρόλο στο επεισόδιο «The Immaculate Election».
* The Larry Sanders Show (1992-1998): Ο Γουότερς έκανε μερικές εμφανίσεις ως ο ίδιος σε αυτό το σόου.
* Ugly Betty (2006-2010): Εμφανίστηκε ως ο ίδιος στο επεισόδιο "Ugly Betty's World".
* RuPaul's Drag Race (2010-σήμερα): Ο Waters έχει κάνει πολλές εμφανίσεις ως guest κριτής σε αυτή την εκπομπή.
Ενώ οι εμφανίσεις του σε άλλα έργα είναι περιορισμένες, ο Τζον Γουότερς είναι πιο διάσημος για τις δικές του μοναδικές και επιδραστικές ταινίες.