Υπάρχουν διάφοροι λόγοι για τους οποίους είναι απίθανο ο Μπέικον να έγραψε τα έργα του Σαίξπηρ. Πρώτον, δεν υπάρχουν άμεσες αποδείξεις που να υποστηρίζουν τον ισχυρισμό. Δεν υπάρχει καμία γνωστή αλληλογραφία μεταξύ του Μπέικον και του Σαίξπηρ και δεν υπάρχουν στοιχεία ότι ο Μπέικον εξέφρασε ποτέ ενδιαφέρον για τη συγγραφή θεατρικών έργων. Δεύτερον, τα στυλ γραφής είναι διαφορετικά. Τα έργα του Σαίξπηρ είναι γραμμένα σε ποιητικό, λυρικό ύφος, ενώ τα έργα του Μπέικον με πιο επίσημο, φιλοσοφικό ύφος. Τρίτον, τα θέματα και οι ιδέες στα έργα του Σαίξπηρ είναι διαφορετικά από εκείνα στα έργα του Μπέικον. Τα έργα του Σαίξπηρ συχνά διερευνούν θέματα αγάπης, απώλειας και προδοσίας, ενώ τα έργα του Μπέικον επικεντρώνονται σε θέματα όπως η πολιτική, η επιστήμη και η φιλοσοφία.
Εκτός από τους λόγους που αναφέρονται παραπάνω, υπάρχει επίσης το γεγονός ότι ο Σαίξπηρ ήταν ένας επιτυχημένος ηθοποιός και θεατρικός συγγραφέας κατά τη διάρκεια της ζωής του. Ήταν πολύ γνωστός και σεβαστός από τους συνομηλίκους του και δεν υπάρχουν στοιχεία που να υποδηλώνουν ότι δεν ήταν ο αληθινός συγγραφέας των έργων του.
Η θεωρία της Βακονικής πατρότητας βασίζεται σε μια σειρά από έμμεσες αποδείξεις και σε κερδοσκοπικούς συλλογισμούς. Δεν υπάρχουν άμεσα στοιχεία που να υποστηρίζουν τον ισχυρισμό και δεν υποστηρίζεται από την πλειοψηφία των μελετητών και των ιστορικών.