Ο θάνατος του Morrison συνέβη στο Παρίσι της Γαλλίας, όπου ζούσε με τη σύντροφό του Pamela Courson. Στις 2 Ιουλίου 1971, ο Μόρισον βρέθηκε αναίσθητος στην μπανιέρα του διαμερίσματός του από τον Κούρσον. Κάλεσε σε βοήθεια και ο Μόρισον μεταφέρθηκε εσπευσμένα στο νοσοκομείο, όπου διαπιστώθηκε ο θάνατός του κατά την άφιξη.
Οι ακριβείς συνθήκες που οδήγησαν στον θάνατο του Μόρισον δεν έχουν ποτέ πλήρως διευκρινιστεί. Ορισμένες πηγές υποστηρίζουν ότι πέθανε από υπερβολική δόση ναρκωτικών, ενώ άλλες υποστηρίζουν ότι μπορεί να υπέφερε από καρδιακή προσβολή ή συνδυασμό παραγόντων. Η έκθεση νεκροψίας έδειξε ότι ο Morrison είχε καταναλώσει μεγάλη ποσότητα αλκοόλ και ηρωίνης πριν από το θάνατό του.
Οι θεωρίες για τον θάνατο του Μόρισον συνεχίζουν να κυκλοφορούν μέχρι σήμερα και παραμένει ένα από τα πιο διαρκή μυστήρια στην ιστορία της ροκ μουσικής. Ο πρόωρος χαμός του Μόρισον σε τόσο νεαρή ηλικία πρόσθεσε στην εμβληματική του θέση και τον έκανε σύμβολο των υπερβολών και των τραγωδιών που συχνά συνοδεύουν τον κόσμο του ροκ εν ρολ.