Υπάρχουν κάποια στοιχεία που υποδηλώνουν ότι οι καισαρικές τομές μπορεί να είχαν γίνει στην αρχαιότητα. Για παράδειγμα, ο αρχαίος Έλληνας γιατρός Ιπποκράτης έγραψε για μια διαδικασία που ονομάζεται «εμβρυοτομή», η οποία περιελάμβανε το άνοιγμα της μήτρας για την αφαίρεση ενός μωρού. Ωστόσο, δεν είναι σαφές εάν όντως έγινε ποτέ εμβρυοτομή και είναι πιθανό ότι ο Ιπποκράτης απλώς έκανε εικασίες.
Η πρώτη τεκμηριωμένη περίπτωση μιας επιτυχημένης καισαρικής τομής πραγματοποιήθηκε το 1500 από έναν Ελβετό γιατρό ονόματι Jacob Nufer. Η ασθενής του Nufer ήταν μια γυναίκα με το όνομα Elisabeth Strüb, η οποία έπασχε από μια πάθηση που ονομάζεται ρήξη μήτρας. Ο Νούφερ έβγαλε με επιτυχία το μωρό από τη μήτρα του Στρούμπ και η μητέρα και το παιδί επέζησαν.
Στους αιώνες που πέρασαν από την εποχή του Νούφερ, οι καισαρικές τομές γίνονται όλο και πιο συχνές. Σήμερα, οι καισαρικές τομές γίνονται στο 30% περίπου όλων των γεννήσεων στις Ηνωμένες Πολιτείες.