Η σύγκρουση της ιστορίας δίνει έμφαση στα συναισθήματα, την εκδίκηση και την αλληλεπίδραση μεταξύ της κοινωνικής προκατάληψης και της εσωτερικής πάλης αντί να διερευνήσει την αλληλεπίδραση μεταξύ ανθρωπότητας και φύσης. Επιπλέον, δεδομένου ότι τα περισσότερα από τα γεγονότα συμβαίνουν εντός των ορίων του Palais Garnier, τα φυσικά στοιχεία δεν τονίζονται ιδιαίτερα σε αυτήν την ιστορία. Επομένως, δεν υπάρχει μια σύγκρουση μεταξύ της ανθρωπότητας και της φύσης που να οδηγεί την αφήγηση στο «The Phantom of the Opera».