Αφού ο Βόλντεμορτ σκοτώνει τον καθηγητή Ντάμπλντορ στο Τάγμα του Φοίνικα, ο Σνέιπ γίνεται δάσκαλος φίλτρων και διευθυντής του Χόγκουαρτς. Παρά τον σκληρό και κατά καιρούς σκληρό χαρακτήρα του, οι αναγνώστες έχουν καταλάβει την πίστη του Σνέιπ στον Ντάμπλντορ και τον ρόλο του ως διπλού πράκτορα για το Τάγμα του Φοίνικα.
Στους Κλήρους του Θανάτου, ωστόσο, η αφοσίωση του Σνέιπ γίνεται και πάλι μυστήριο, καθώς παρέχει πρόθυμα στον Βόλντεμορτ πληροφορίες για την τοποθεσία του Χάρι. Ο Χάρι, πιστεύοντας ότι ο Σνέιπ είναι εχθρός του, τον κυνηγάει όταν βλέπει αυτόν και τον καθηγητή ΜακΓκόνγκολ να τρέπονται σε φυγή κατά τη διάρκεια της Μάχης του Χόγκουαρτς.
Είναι ο Nagini, το φίδι του Voldemort, που σκοτώνει τον Snape με ένα δάγκωμα στο λαιμό του. Καθώς πεθαίνει, ο Σνέιπ χρησιμοποιεί την τελευταία του δύναμη για να φέρει στο μυαλό του τις αναμνήσεις που μοιράστηκε με τον Χάρι. Μέσα από αυτές τις αναμνήσεις ο Χάρι μαθαίνει τελικά την αλήθεια για τον χαρακτήρα του Σνέιπ, ανακαλύπτοντας ότι η πίστη του δεν ήταν στον Βόλντεμορτ, αλλά στη Λίλι και τον Ντάμπλντορ, και ότι οι πράξεις του οδηγήθηκαν από έναν τραγικό και ανεκπλήρωτο έρωτα που τελείωσε με το θάνατο της Λίλι.