* Ζωή στα βαθιά: Ο Thomson και η ομάδα του ανακάλυψαν μια τεράστια γκάμα άγνωστων μέχρι τότε μορφών ζωής που ζουν στα βάθη της θάλασσας, συμπεριλαμβανομένων νέων ειδών ψαριών, ασπόνδυλων και μικροοργανισμών. Αυτό αμφισβήτησε την επικρατούσα πεποίθηση ότι δεν θα μπορούσε να υπάρξει ζωή σε τέτοια βάθη.
* Τοπογραφία βυθού ωκεανού: Η αποστολή Challenger χαρτογράφησε σχολαστικά τον πυθμένα του ωκεανού, αποκαλύπτοντας την περίπλοκη και ποικίλη τοπογραφία του, συμπεριλαμβανομένων βουνών, χαρακωμάτων και τεράστιων πεδιάδων. Αυτά τα δεδομένα έθεσαν τα θεμέλια για τη σύγχρονη ωκεανογραφία.
* Ωκεάνια ρεύματα: Ο Thomson μελέτησε τα ωκεάνια ρεύματα και την επιρροή τους στη θαλάσσια ζωή και το κλίμα, βοηθώντας στην ανάπτυξη της κατανόησής μας για την παγκόσμια κυκλοφορία των ωκεανών.
* Θαλάσσια ιζήματα: Η αποστολή συνέλεξε και ανέλυσε τεράστιες ποσότητες θαλάσσιων ιζημάτων, παρέχοντας πληροφορίες για τη γεωλογική ιστορία των ωκεανών και τις διαδικασίες που διαμορφώνουν τη Γη.
* Η έννοια της "άβυσσος του Challenger": Αυτός ο όρος επινοήθηκε από τον Thomson για να περιγράψει το βαθύτερο μέρος του βυθού του ωκεανού, το οποίο ανακάλυψαν κατά τη διάρκεια της αποστολής. Αργότερα έδωσε τη θέση του στον όρο «Τάφρο Μαριάνα».
Το έργο του Thomson στην αποστολή Challenger ήταν ένα μνημειώδες επίτευγμα στην επιστήμη, αλλάζοντας θεμελιωδώς την κατανόησή μας για τους ωκεανούς και τη ζωή μέσα σε αυτούς. Θεωρείται ένας από τους πρωτοπόρους της σύγχρονης ωκεανογραφίας.