Οι μετρητές ζημιών τοποθετούνται στο κουτί μετρητών ζημιών ενός Pokémon, το οποίο βρίσκεται στην κάτω αριστερή γωνία της κάρτας. Το κιβώτιο μετρητή ζημιών μπορεί να χωρέσει έως και 10 μετρητές ζημιών και όταν είναι γεμάτο, το Pokémon τίθεται νοκ άουτ.
Οι μετρητές ζημιών μπορούν να τοποθετηθούν σε ένα Pokémon με διάφορες επιθέσεις. Ορισμένες επιθέσεις προκαλούν συγκεκριμένη ποσότητα ζημιάς, ενώ άλλες κάνουν ζημιά με βάση τα στατιστικά των επιτιθέμενων Pokémon. Υπάρχουν επίσης κάποιες επιθέσεις που μπορούν να προκαλέσουν έμμεση ζημιά, όπως δηλητηρίαση ή κάψιμο των Pokémon του αντιπάλου.
Όταν ένα Pokémon είναι νοκ άουτ, τοποθετείται στο σωρό απόρριψης. Ο παίκτης που έριξε νοκ άουτ το Pokémon τότε τραβάει ένα έπαθλο. Οι κάρτες βραβείων μπορούν να χρησιμοποιηθούν για να ενεργοποιήσετε τα Pokémon σας ή για να τραβήξετε περισσότερες κάρτες από την τράπουλα σας.
Οι μετρητές ζημιών αποτελούν σημαντικό μέρος του Παιχνιδιού με κάρτες Pokémon, καθώς βοηθούν να παρακολουθείτε την πρόοδο του παιχνιδιού και να προσδιορίσετε ποια Pokémon είναι ακόμα στο παιχνίδι.