* Ατομικά δυνατά και αδύνατα σημεία: Διαφορετικά Pokémon έχουν διαφορετικά στατιστικά, κινήσεις και ικανότητες, κάτι που τα κάνει καλύτερα σε διαφορετικά σενάρια.
* Προπόνηση και επίπεδα: Ένα καλά εκπαιδευμένο και υψηλού επιπέδου Pokémon θα είναι πάντα πιο δυνατό από ένα χαμηλό επίπεδο, ανεξάρτητα από το είδος του.
* Στρατηγική και ικανότητα παίκτη: Το πώς ένας παίκτης χρησιμοποιεί τα Pokémon του στη μάχη μπορεί να επηρεάσει πολύ την αποτελεσματικότητά του.
Ωστόσο, ορισμένα Pokémon θεωρούνται συχνά πολύ ισχυρά στο Pokémon Crystal λόγω των ισχυρών στατιστικών και των κινήσεων τους:
* Mewtwo: Αναμφισβήτητα το πιο ισχυρό Pokémon σε ολόκληρο το franchise, το Mewtwo είναι ένα Psychic τύπου με απίστευτα στατιστικά και πρόσβαση σε ισχυρές κινήσεις όπως το Psychic και το Psybeam.
* Tyranitar: Ένα ψευδο-θρυλικό Pokémon με τεράστια επίθεση και άμυνα, το Tyranitar είναι μια υπολογίσιμη δύναμη στις μάχες.
* Γυαράδος: Με την υπογραφή του Dragon Dance, το Gyarados μπορεί να γίνει απίστευτα ισχυρό και να σαρώσει ολόκληρες ομάδες.
* Δραγονίτης: Ένα άλλο ψευδο-θρυλικό Pokémon, το Dragonite είναι ένας ισχυρός τύπος ιπτάμενου/δράκου με εξαιρετική κίνηση.
* Alakazam: Ένα Psychic τύπου με απίστευτη ειδική επίθεση, το Alakazam μπορεί να είναι απίστευτα ισχυρό όταν χρησιμοποιείται αποτελεσματικά.
* Snorlax: Αν και αργό, το Snorlax διαθέτει απίστευτη ποσότητα HP και άμυνα, γεγονός που καθιστά δύσκολο να το καταρρίψεις.
Τελικά, το "πιο δυνατό" Pokémon στο Crystal εξαρτάται από τις ατομικές προτιμήσεις, το στυλ παιχνιδιού και τις συγκεκριμένες προκλήσεις που αντιμετωπίζετε.