* 1567: Μετά τον θάνατο του συζύγου της, Λόρδου Ντάρνλι, και τον γάμο της με τον κόμη του Μπόθγουελ, η Μαίρη αναγκάστηκε να παραιτηθεί από τον θρόνο της Σκωτίας και φυλακίστηκε στο Κάστρο Λόχλεβεν .
* 1568: Ξέφυγε από το Κάστρο του Λόχλεβεν, αλλά ηττήθηκε στη μάχη του Λάνγκσαϊντ και διέφυγε στην Αγγλία, όπου φυλακίστηκε για το υπόλοιπο της ζωής της. Αρχικά κρατήθηκε στο Κάστρο Carlisle.
* 1568-1572: Μεταφέρθηκε στο Κάστρο του Μπόλτον και στη συνέχεια στο Κάστρο του Σέφιλντ.
* 1572-1587: Η Mary μεταφέρθηκε στο κάστρο Tutbury, στο Wingfield Manor, στο Coventry, στο Chatsworth House και, τέλος, στο Κάστρο Fotheringhay, όπου δικάστηκε και εκτελέστηκε το 1587.
Είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι δεν κρατούνταν πάντα σε σκληρές συνθήκες. Μερικές από τις φυλακίσεις της ήταν πιο άνετες από άλλες, ανάλογα με την τοποθεσία και το πολιτικό κλίμα. Ωστόσο, ήταν πάντα υπό αυστηρή φρουρά και δεν ξαναβρήκε ποτέ την ελευθερία της.